转录后修饰组测序

m6A（N6-methyladenosine，6-甲基腺嘌呤）
是真核生物mRNA内部序列中最常见的一种甲基化修饰，
同时受到甲基转移酶/去甲基化酶以及一些RNA结合蛋白的共同调控，在细胞内是一个动态可逆的过程。
高通量测序与抗体免疫沉淀相结合（MeRIP-Seq或m6A-Seq），
能够在全转录组范围内检测转录本上的m6A修饰水平。
通过在人、小鼠、酵母和拟南芥等系统内的研究，发现m6A可能会直接或间接影响mRNA的出核转运、翻译和降解等。
MeRIP-Seq可以比较不同细胞、组织、样本间的RNA甲基化修饰模式的差异，
可广泛用于干细胞、各种疾病样本的研究。
通过对沉淀下来的RNA片段进行高通量测序，
进而结合生物信息学分析，即可全基因组范围内对m6A修饰的状况进行系统研究（如下图） 。



目前的meRIP-seq结果显示，m6A修饰在人转录组中广泛存在，
超过7000个mRNA和300个lncRNA都含有这种修饰。
这种修饰富集分布在mRNA的终止密码子附近和3’UTR区域，暗示m6A修饰具有重要的调控功能。
很多m6A修饰位点在人和小鼠中保守存在，且某些m6A修饰在不同发育时期，
其修饰水平也在不断变化，同样暗示其重要的调控功能。



m6A已知的最主要功能是调控mRNA的稳定性，
胞质内经过m6A修饰的mRNA可以被YTHDF2识别，使其富集到P-body从而加速mRNA的降解。
此外，m6A修饰还可以改变RNA的二级结构、调控microRNA的靶标识别来调控mRNA的稳定性。
在核内，m6A修饰可以调控RNA的剪接、出核过程，从而调控基因表达。



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